Глава 3
Деятельность В.В. Марковникова в Московском университете

После ухода из Казанского университета Марковников и Головкинский были приглашены в молодой Новороссийский университет в Одессе и уже 18 декабря 1871 г. они были избраны там ординарными профессорами.
	Здесь была довольно хорошо по тому времени оборудованная химическая лаборатория, организованная известным русским химиком Н.Н.Соколовым. Марковников в течение 1872-73 учебного года вел курс органической химии и прочел несколько публичных лекций. Две вступительные лекции, прочитанные в Новороссийском университете 16 и 17 марта 1872 г. были напечатаны и обратили на себя внимание русских химиков. В этих лекциях он продолжил идею о взаимном влиянии атомов в химических соединениях и поставил вопрос о физическом пространственном расположении атомов в молекулах: "Трудно, однако, представить, что между химическим взаимодействием и физическом положении атомов в частице не существует прямых определенных соотношений" .
	В этих лекциях Марковников дал много материала для историографии теории химического строения, выступая как самый глубокий и объективный ее историк. Опираясь на многочисленные факты, он отстаивал приоритет Бутлерова в создании теории химического строения, между тем как в зарубежной литературе, как правило, этот приоритет приписывался Кекуле и реже Куперу. Впервые с резкой критикой Кекуле Марковников выступил в магистерской диссертации (1865 г.), а затем неоднократно возвращался к этому вопросу статьях и выступлениях.
	Таким образом, Марковникова можно считать основоположником того направления в историографии теории химического строения, представители которого стремились объективно оценивать историко-химические факты и заслуги ученых всех стран.
	В октябре 1872г. Марковников не без колебаний принял предложение декана физико-математического факультета Московского университета А.Ю. Давыдова занять вакантную кафедру химии, которая находилась в катастрофическом положении: лекции не читались, лаборатория была без присмотра, имущество ее расхищалось.
В Московском университете В.В. Марковников провел огромную многолетнюю работу по организации и оснащению химической лаборатории, по настройке новой большой лаборатории. Его преподавательская деятельность началась с 1873/74 учебного года: он принял на себя чтение органической химии и руководство практическими занятиями по аналитической химии, т.к. опыт преподавания этих дисциплин сложился у него в Казанском университете.
В 1887г. была построена новая лаборатория и начались практические занятия студентов по органической химии. К моменту прихода Марковникова в Московском университете отсутствовали какие-либо химические традиции, каковые были в Казани после Бутлерова, и он почувствовал необходимость внести сюда традиции своего учителя, который создавал в лаборатории свободную непринужденную обстановку, всегда работал на глазах учеников, рассказывал о своих работах и не делал секретов относительно научных планов.
В преподавании и постановке практических занятий и научных работах по органической химии Марковников поставил на первый план самостоятельную работу студента и молодого научного работника, его принципом было: "Следует пускать студента на глубокое место: кто выплывет, значит будет толк". Эти нововведения не замедлили скоро сказаться - число студентов-естественников, желающих заниматься химией под руководством В.В. Марковникова, неуклонно росло из года в год. Из его лаборатории стало выходить научно-исследовательских работ значительно больше, чем из какого-либо другого научного центра России. В Московском университете В.В.Марковников создал крупнейшую школу русских химиков, из которой вышли замечательные русские ученые: Н.Я. Демьянов, И.А. Каблуков, Н.М. Кижнер, М.И. Коновалов, А.Е. Чичибабин, А.Н. Реформатский и др.  В лаборатории Марковникова работала Юлия Всеволодовна Лермонтова – первая из русских женщин-химиков, получившая степень доктора.
	Двадцать лет (1873-93 гг.) Марковников руководил кафедрой аналитической и органической химии Московского университета, а затем заведывание перешло к профессору Н.Д.Зелинскому . Однако Марковников не ушел из университета и продолжал в нем работать вплоть до своей кончины – до 11 февраля 1904 года.